Την Τρίτη 8 Ιουλίου 2014. Μια ομάδα ερευνητών από το ινστιτούτο Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) έχει συμμετάσχει σε μια διεθνή έρευνα που έχει εντοπίσει 518 νέα μικροβάρια, άγνωστα μέχρι τώρα, στην ανθρώπινη μικροβιακή χλωρίδα (εντερική χλωρίδα).
Η έρευνα, στην οποία οι επιστήμονες έχουν χρησιμοποιήσει μια νέα προσέγγιση για τη βιοπληροφορική ανάλυση, έχει επίσης επεκτείνει τον κατάλογο των γνωστών μικροβιακών γονιδίων, από 3 έως 10 εκατομμύρια.
Τα αποτελέσματα αυτής της έρευνας, που δημοσιεύθηκε την Κυριακή από το περιοδικό Nature Biotechnology, αποτελούν μέρος του ευρωπαϊκού προγράμματος MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), που διαθέτει 11, 4 εκατομμύρια ευρώ για να διερευνήσει πώς σχετίζεται το ανθρώπινο μικροβιοκτόνο με την υγεία και την ασθένεια . Το Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) είναι ένα από τα 13 που συμμετέχουν σε αυτό το πρόγραμμα - και το μόνο ισπανικό κέντρο - υπό την καθοδήγηση του Dr. Francisco Guarner, ο οποίος εξήγησε ότι δεν έχουν όλα τα δείγματα που έχουν μελετηθεί αριθμός άγνωστων ειδών.
Τα δείγματα της εντερικής χλωρίδας ορισμένων ατόμων έχουν πολύ λίγα από αυτά τα είδη και, όταν αναλύονται λεπτομερώς, έχουν δει ότι είναι δείγματα ασθενών με νόσο του Crohn. "Αυτό δείχνει ότι αυτά τα είδη, μέχρι τώρα άγνωστα, είναι πιθανόν αυτά που κάνουν τη διαφορά μεταξύ της μικροβιοτότητας υγιών ανθρώπων και εκείνων των ασθενών", ανακοίνωσε ο Guarner.
Σύμφωνα με τον ερευνητή, τα δεδομένα αυτά ανοίγουν στρατηγικές για την αποκατάσταση αυτών των ειδών με διατροφικές παρεμβάσεις: χορήγηση ινών, πρεβιοτικά που βοηθούν στην επιλεκτική ανάπτυξη ορισμένων ειδών ή προβιοτικών.
Αυτά τα άγνωστα βακτηρίδια είναι πιθανώς τα λεγόμενα "καλά βακτήρια" επειδή δεν είναι τα τυπικά που προκαλούν μόλυνση, ούτε είναι γνωστά ή απομονωμένα πριν. Σύμφωνα με τον Guarner, τα βακτηρίδια που ανακαλύφθηκαν δεν μπορούν να απομονωθούν επειδή «σχεδόν σίγουρα δεν θα επιβιώσουν έξω από το παχύ έντερο για να μεταμοσχευθούν».
Ο υπεύθυνος της εργασίας και ερευνητής της Φυσιολογίας και της Φυσιογενούς Παθοφυσιολογίας της VHIR ανέφερε ότι τα νέα είδη που ανακαλύφθηκαν "δεν καλλιεργούνται, είναι πολύ ευαίσθητα στο οξυγόνο, δηλαδή είναι πολύ αυστηρά αναερόβια και καθιερώνουν μεγάλη εξάρτηση από το περιβάλλον τους για να είναι σε θέση να επιβιώσουν. " "Για τον ίδιο λόγο, όταν πήγαμε στις βάσεις δεδομένων δεν βρήκαμε ένα ίχνος και μέχρι τώρα δεν ήξερα τίποτα γι 'αυτούς", δήλωσε ο Guarner.
Η ανακάλυψη έγινε δυνατή χάρη σε μια νέα προσέγγιση της βιοπληροφορικής ανάλυσης, η οποία επέτρεψε να «επιφανειαστούν» αυτά τα είδη.
"Σήμερα - σύμφωνα με τον Guarner - μόνο το 10% του γενετικού υλικού που έχει αναλυθεί είναι γνωστό με 95% αξιοπιστία. Αυτό αφήνει μια τεράστια γκρίζα περιοχή που επεξεργάζεται αυτή τη στιγμή".
Η μελέτη ανίχνευσε 741 διαφορετικά μεταγονιδιωματικά είδη, που ονομάστηκαν για την αδυναμία να τους δοθεί ένα όνομα. Σε αντίθεση με τις βάσεις δεδομένων, οι ερευνητές έχουν διαπιστώσει ότι 115 από αυτά τα είδη ήταν ήδη γνωστά, ενώ 518 είναι άγνωστα. τα υπόλοιπα 108 είναι εν μέρει γνωστά.
«Τώρα γνωρίζουμε τι φαίνεται το γονιδίωμα αυτών των μεταγονιδιωματικών ειδών, αλλά όχι τα ονόματα και τα επώνυμά τους», εξήγησε ο Guarner.
Υπάρχει ένας μικρός αριθμός των οποίων τα είδη δεν είναι γνωστά αλλά το φύλο τους ή η οικογένεια στην οποία ανήκουν και περίπου 200 μεταγονιδιωματικά είδη από αυτά που περιγράφονται δεν μπορούν να ταξινομηθούν με κανέναν τρόπο, δεδομένου ότι περισσότερο από το 80% των γονιδίων τους είναι εντελώς άγνωστα σήμερα
Σύμφωνα με επιστήμονες, οι μικροοργανισμοί που ζουν σε ανθρώπους είναι περίπου 100 δισεκατομμύρια, 10 φορές μεγαλύτεροι από τον συνολικό αριθμό των ανθρώπινων κυττάρων.
Τα αρχικά αποτελέσματα αυτού του έργου, το 2010, έδειξαν 3.300.000 διαφορετικά γονίδια, μεταφρασμένα σε 20.000 διαφορετικές λειτουργίες, 5.000 από τις οποίες ήταν εντελώς άγνωστες μέχρι στιγμής.
Κάθε άτομο έχει περίπου 600.000 από αυτά τα μικροβιακά γονίδια και 300.000 επαναλαμβάνονται συνεχώς μεταξύ όλων των ατόμων. "Σε αυτή τη νέα μελέτη, ο αριθμός πολλαπλασιάζεται με τρία και φτάνουν τα 9.879.896 διαφορετικά γονίδια", δήλωσε ο Guarner.
Πηγή:
Ετικέτες:
Νέα Φάρμακα Ομορφιά
Η έρευνα, στην οποία οι επιστήμονες έχουν χρησιμοποιήσει μια νέα προσέγγιση για τη βιοπληροφορική ανάλυση, έχει επίσης επεκτείνει τον κατάλογο των γνωστών μικροβιακών γονιδίων, από 3 έως 10 εκατομμύρια.
Τα αποτελέσματα αυτής της έρευνας, που δημοσιεύθηκε την Κυριακή από το περιοδικό Nature Biotechnology, αποτελούν μέρος του ευρωπαϊκού προγράμματος MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), που διαθέτει 11, 4 εκατομμύρια ευρώ για να διερευνήσει πώς σχετίζεται το ανθρώπινο μικροβιοκτόνο με την υγεία και την ασθένεια . Το Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) είναι ένα από τα 13 που συμμετέχουν σε αυτό το πρόγραμμα - και το μόνο ισπανικό κέντρο - υπό την καθοδήγηση του Dr. Francisco Guarner, ο οποίος εξήγησε ότι δεν έχουν όλα τα δείγματα που έχουν μελετηθεί αριθμός άγνωστων ειδών.
Τα δείγματα της εντερικής χλωρίδας ορισμένων ατόμων έχουν πολύ λίγα από αυτά τα είδη και, όταν αναλύονται λεπτομερώς, έχουν δει ότι είναι δείγματα ασθενών με νόσο του Crohn. "Αυτό δείχνει ότι αυτά τα είδη, μέχρι τώρα άγνωστα, είναι πιθανόν αυτά που κάνουν τη διαφορά μεταξύ της μικροβιοτότητας υγιών ανθρώπων και εκείνων των ασθενών", ανακοίνωσε ο Guarner.
"Καλά βακτηρίδια"
Σύμφωνα με τον ερευνητή, τα δεδομένα αυτά ανοίγουν στρατηγικές για την αποκατάσταση αυτών των ειδών με διατροφικές παρεμβάσεις: χορήγηση ινών, πρεβιοτικά που βοηθούν στην επιλεκτική ανάπτυξη ορισμένων ειδών ή προβιοτικών.
Αυτά τα άγνωστα βακτηρίδια είναι πιθανώς τα λεγόμενα "καλά βακτήρια" επειδή δεν είναι τα τυπικά που προκαλούν μόλυνση, ούτε είναι γνωστά ή απομονωμένα πριν. Σύμφωνα με τον Guarner, τα βακτηρίδια που ανακαλύφθηκαν δεν μπορούν να απομονωθούν επειδή «σχεδόν σίγουρα δεν θα επιβιώσουν έξω από το παχύ έντερο για να μεταμοσχευθούν».
Ο υπεύθυνος της εργασίας και ερευνητής της Φυσιολογίας και της Φυσιογενούς Παθοφυσιολογίας της VHIR ανέφερε ότι τα νέα είδη που ανακαλύφθηκαν "δεν καλλιεργούνται, είναι πολύ ευαίσθητα στο οξυγόνο, δηλαδή είναι πολύ αυστηρά αναερόβια και καθιερώνουν μεγάλη εξάρτηση από το περιβάλλον τους για να είναι σε θέση να επιβιώσουν. " "Για τον ίδιο λόγο, όταν πήγαμε στις βάσεις δεδομένων δεν βρήκαμε ένα ίχνος και μέχρι τώρα δεν ήξερα τίποτα γι 'αυτούς", δήλωσε ο Guarner.
Διαφορετικά μεταγονιδιωματικά είδη
Η ανακάλυψη έγινε δυνατή χάρη σε μια νέα προσέγγιση της βιοπληροφορικής ανάλυσης, η οποία επέτρεψε να «επιφανειαστούν» αυτά τα είδη.
"Σήμερα - σύμφωνα με τον Guarner - μόνο το 10% του γενετικού υλικού που έχει αναλυθεί είναι γνωστό με 95% αξιοπιστία. Αυτό αφήνει μια τεράστια γκρίζα περιοχή που επεξεργάζεται αυτή τη στιγμή".
Η μελέτη ανίχνευσε 741 διαφορετικά μεταγονιδιωματικά είδη, που ονομάστηκαν για την αδυναμία να τους δοθεί ένα όνομα. Σε αντίθεση με τις βάσεις δεδομένων, οι ερευνητές έχουν διαπιστώσει ότι 115 από αυτά τα είδη ήταν ήδη γνωστά, ενώ 518 είναι άγνωστα. τα υπόλοιπα 108 είναι εν μέρει γνωστά.
«Τώρα γνωρίζουμε τι φαίνεται το γονιδίωμα αυτών των μεταγονιδιωματικών ειδών, αλλά όχι τα ονόματα και τα επώνυμά τους», εξήγησε ο Guarner.
Υπάρχει ένας μικρός αριθμός των οποίων τα είδη δεν είναι γνωστά αλλά το φύλο τους ή η οικογένεια στην οποία ανήκουν και περίπου 200 μεταγονιδιωματικά είδη από αυτά που περιγράφονται δεν μπορούν να ταξινομηθούν με κανέναν τρόπο, δεδομένου ότι περισσότερο από το 80% των γονιδίων τους είναι εντελώς άγνωστα σήμερα
Ένα άτομο έχει 600.000 μικροβιακά γονίδια
Σύμφωνα με επιστήμονες, οι μικροοργανισμοί που ζουν σε ανθρώπους είναι περίπου 100 δισεκατομμύρια, 10 φορές μεγαλύτεροι από τον συνολικό αριθμό των ανθρώπινων κυττάρων.
Τα αρχικά αποτελέσματα αυτού του έργου, το 2010, έδειξαν 3.300.000 διαφορετικά γονίδια, μεταφρασμένα σε 20.000 διαφορετικές λειτουργίες, 5.000 από τις οποίες ήταν εντελώς άγνωστες μέχρι στιγμής.
Κάθε άτομο έχει περίπου 600.000 από αυτά τα μικροβιακά γονίδια και 300.000 επαναλαμβάνονται συνεχώς μεταξύ όλων των ατόμων. "Σε αυτή τη νέα μελέτη, ο αριθμός πολλαπλασιάζεται με τρία και φτάνουν τα 9.879.896 διαφορετικά γονίδια", δήλωσε ο Guarner.
Πηγή:
